Cuando terminó la Guerra de los Mil Días, fue elegido como presidente RAFAEL REYES  en el año de 1.904.

Trató de ser una persona conciliadora para unir al país después de la guerra.  Tenía muchos proyectos e ideas, pero como el congreso era muy lento en tomar las decisiones que él consideraba importantes, lo cerró y asumió el poder individualmente.  Esto hizo que algunos políticos le hicieran una muy fuerte oposición e inclusive se planeara un atentado para matarlo en 1.906.

Organizó el ejército nacional y la marina.  Promovió las carreras de medicina y de comercio.  Poco a poco hizo mejorar la situación económica, con la cual moneda recperó su valor y el gobierno  comenzó a obtener de nuevo créditos nacionales e internacionales.  Dio mucho apoyo a la construcción de vías y carreteras.  Promovió la industria petrolera.

A medida wue iba mejorando la situación económica y el apoyo a las obras públicas, se requería más trabajadores en las industrias y obreros.  Así poco a poco también algunas personas empezaron a encontrar trabajos en las principales ciudades y se mejoraba el ambiente social.